Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnna1P26231 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms