Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms