Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb7P26011 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms