Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lmo2P25801 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms