Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkchP23298 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms