Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gja1P23242 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms