Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp36P22893 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp36P22893 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp36P22893 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp36P22893 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp36P22893 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp36P22893 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp36P22893 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp36P22893 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp36P22893 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp36P22893 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp36P22893 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms