Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou3f1P21952 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms