Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms