Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcer1aP20489 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcer1aP20489 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms