Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SagP20443 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SagP20443 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SagP20443 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SagP20443 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SagP20443 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SagP20443 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SagP20443 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SagP20443 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SagP20443 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SagP20443 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SagP20443 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SagP20443 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SagP20443 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SagP20443 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SagP20443 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms