Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P20040 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P20040 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P20040 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P20040 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P20040 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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