Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Esr1P19785 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms