Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a1P19437 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms