Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms