Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lama1P19137 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms