Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RargP18911 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RargP18911 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RargP18911 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms