Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svs4P18419 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Svs4P18419 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Svs4P18419 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs4P18419 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms