Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcnaP17918 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms