Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs1P17533 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs1P17533 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms