Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp53P15975 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp53P15975 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms