Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme1P15532 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme1P15532 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme1P15532 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms