Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnc1P15388 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms