Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms