Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrphP15331 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrphP15331 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrphP15331 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrphP15331 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PrphP15331 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrphP15331 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrphP15331 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms