Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms