Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt1P13864 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms