Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calb1P12658 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calb1P12658 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms