Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtcP11725 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtcP11725 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtcP11725 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtcP11725 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtcP11725 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtcP11725 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtcP11725 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtcP11725 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtcP11725 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtcP11725 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtcP11725 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtcP11725 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms