Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga5P11688 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga5P11688 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms