Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DmdP11531 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DmdP11531 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DmdP11531 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DmdP11531 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DmdP11531 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DmdP11531 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DmdP11531 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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DmdP11531 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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DmdP11531 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DmdP11531 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DmdP11531 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DmdP11531 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DmdP11531 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DmdP11531 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DmdP11531 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DmdP11531 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms