Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatspereP0DP43 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatspereP0DP43 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms