Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprqP0C5E4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms