Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa9P09631 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa9P09631 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms