Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefmP08553 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefmP08553 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefmP08553 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NefmP08553 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NefmP08553 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NefmP08553 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NefmP08553 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NefmP08553 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefmP08553 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefmP08553 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefmP08553 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefmP08553 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefmP08553 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NefmP08553 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefmP08553 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefmP08553 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefmP08553 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefmP08553 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefmP08553 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms