Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApoeP08226 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms