Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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