Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Spta1P08032 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Spta1P08032 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Spta1P08032 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Spta1P08032 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Spta1P08032 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spta1P08032 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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