Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa4P06728 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms