Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb1P04230 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms