Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd1P03888 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtnd1P03888 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms