Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01822 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01822 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01822 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01822 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01822 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01822 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01822 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01822 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01822 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01822 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01822 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01822 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms