Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01679 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01679 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01679 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01679 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01679 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01679 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01679 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01679 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms