Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01669 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01669 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01669 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01669 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01669 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01669 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01669 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01669 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms