Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01663 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01663 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01663 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01663 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01663 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01663 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01663 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01663 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01663 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01663 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01663 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01663 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01663 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01663 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms