Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01656 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01656 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01656 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01656 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01656 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms