Protein–RNA interactions for Protein: P01637

Ig kappa chain V-V region T1, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01637 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01637 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01637 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01637 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01637 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01637 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01637 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01637 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01637 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01637 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01637 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01637 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01637 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01637 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms