Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01635 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01635 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01635 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01635 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01635 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms