Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl2O89104 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sypl2O89104 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms