Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops4O88544 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops4O88544 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms